近期有關國安危機的討論引發了對軍隊滲透問題的關注，並將焦點放在政府是否應該對現有的國安法和軍法進行全面修訂。一位國防領域的專家指出，隨著外部威脅與內部安全問題的加劇，尤其是軍隊中的滲透活動問題，政府已開始考慮設立一套綜合的反滲透法案，將軍事、網絡安全及兩岸關係進行法律調整，以強化國家安全。這些提議包括修訂「兩岸人民關係條例」以及出台新型的數位中介法，規範數位平台的管理，並對社交媒體等加大監管，防止外國勢力的滲透。

不過，也有專家表示，這樣的法律進程可能會對公民自由造成威脅，特別是對言論自由和隱私權的侵犯。因此，在修訂過程中，必須謹慎行事，避免過度干預個人權利。此外，對軍隊滲透的應對，也應該更多依賴改進保防機制，增加對軍隊內部的監督，而不僅僅依賴軍法來處理此類問題。

更有學者指出，政府在此時提出的反滲透法案，其背後或許也受到外部壓力，特別是來自美國的影響。美國政府一向對台灣的軍事動員能力保持高度關注，這樣的法律修訂，可能是台灣對外展現其戰略決心的一部分。